มหาวิทยาลัยแม่โจ้โดยกองแผนงาน ได้พัฒนาระบบเพื่อติดตามและรายงานผลการดำเนิงานจำนวน 2 ระบบ ประกอบด้วย

1. ระบบ KPI Monitor สำหรับติดตามและรายงานผลการดำเนิงานตามตัวชี้วัด

2. ระบบ MJU Strategic Gantt Chart สำหรับติดตามและรายงานผลการดำเนิงานกิจกรรม/โครงการสำคัญของมหาาวิทยาลัย

และได้มีการรายงานผลการดำเนินงานต่อคณะกรรมการไม่ว่าจะเป็นคณะกรรมการที่ประชุมรองอธิการบดี และผู้ช่วยอธิการบดี กรรมการบริหารมหาวิทยาลัย และสภามหาวิทยาลัย อย่างต่อเนื่อง